Ini adalah tahun ke-16 era Meiji. Lima tahun telah berlalu sejak Kenshin Himura menghentikan pemberontakan Makoto Shishio. Meskipun kobaran api dari revolusi yang sedang tumbuh telah padam, bekas luka yang tersisa di belakangnya masih terasa di seluruh Jepang. Sisa-sisa kelompoknya — meski tersebar — masih ada. Beberapa menemukan kedamaian sementara yang lain terus berjuang.
